La Sezione Protezione Civile è la struttura della Presidenza della Giunta della Regione Puglia deputata alla gestione, su scala regionale, delle attività messe in campo per tutelare l’integrità della vita, i beni, gli insediamenti, gli animali e l’ambiente dai danni o dal pericolo di danni che derivano dalle calamità: previsione, prevenzione e mitigazione dei rischi, gestione delle emergenze e loro superamento.

Il Sistema regionale di protezione civile, come individuato dalla Legge regionale 53/2019, è composto, oltre che dalla sezione Protezione Civile, anche dalle Province e dai Comuni, ognuno dei quali ha compiti, funzioni e responsabilità specifiche sul territorio. 
La struttura regionale di protezione civile è componente del sistema nazionale e, a livello regionale, svolge attività di coordinamento, indirizzo e promozione.